La leyenda dice que el monasterio fue fundado en el siglo VIII por San Paulino, si bien la tradición también le otorga esta fundación a Carlomagno. Aparece documentado por primera vez en una concesión de diezmos que hizo el rey Alfons I, en 1175.

En el siglo XII el gobernador de la Vall y sus asesores juraron respetar y guardar las libertades y privilegios de los araneses en esta iglesia.

El cenobio sufrió los efectos de la guerra entre Joan II y el conde de Pallars , en 1472, quedando prácticamente destruido. En 1506, el rey Ferran II lo restauró y fue nuevamente ocupado por frailes agustinianos, en este caso procedentes del monasterio de Santa Maria de Gracia de Lleida. Esta comunidad se mantuvo hasta la exclaustración de 1835, momento en que el convento fue demolido.

Durante la Guerra Civil se utilizó la iglesia como polvorín y acabó siendo dinamitada. A finales del siglo XX se consolidaron y restauraron las paredes que todavía se mantenían de pie.

El edificio que nos ha llegado fue construido en el siglo XII, si bien sufrió numerosas reformas a lo largo de los siglos, especialmente importantes en el siglo XV.

Tenía planta basilical de tres naves coronadas con tres ábsides semicirculares al est.

De estos sólo se ha conservado el central, mientras que el del lado sur fue transformado en una capilla de planta cuadrada, cubierta con bóveda apuntada.

El ábside sur está prácticamente derruido en su totalidad, si bien todavía se conserva la parte baja de sus muros.

Por la parte exterior todavía podemos ver las lesenas que originariamente decoraban los tres ábsides. 

El ábside central conserva además un fragmento de un friso de dientes de sierra, bajo del cual encontramos un friso de dobles arcuaciones ciegas en gradación y sostenidas por pequeñas ménsulas. En la parte interior del arco hay esculpido un rombo.

En el ábside se abren tres ventanas de medio punto y doble derrame.

En la vecina iglesia de Sant Miquèu de Viella se conserva la imagen del Cristo de Mijaran. Fue trasladada en 1936 cuando fue destruido el templo durante la Guerra Civil. Formaba parte de un conjunto escultórico de un Descendimiento de la Cruz, similar a los que podemos encontrar en el Valle de Boí. Por sus características se cree que también fue obra del Maestro de Erill. Sólo nos ha llegado una parte de esta magnífica talla policromada del siglo XII. Se cree que alcanzaba más de dos metros de altura. Son muy interesantes las trazas de los cabellos y la barba, con trenzas talladas en zig-zag y espirales.